Information for Lmscaffold962.30
· Gene Ontology:
no information
· KEGG information:
no information
· Enzyme Commission number (EC):
no information
· Gene family:
bZIP_1/PF00170; bZIP_2/PF07716
· Interpro information:
· Expression data: (root) (FPKM)
· Simple Sequence Repeat (SSR) data:
| SSR nr. | SSR type | SSR | size | start | end |
| | | | | |
· Protein sequence: (523 aa)
>Lmscaffold962.30
MGDSDTTMMQRVNSSSATSPSSIPKQLSPNQHLNSSLIRSQQQQFRQSFTGNRAGAPPPIPPVSPYSSQIPATLQPRHFRSLSQPSSFFSADSLPPLNPTPSPSISLSVKEKNGTGFNPSLPPSMCHTSSSRNAGDGENLPPRKSHRRSNSDITFGFSSMMNQNQKSPPLIPSRSLERSVSGGEVSDWSNLVKEEPREGFFKGRKSEGETAMDDVFTAYMNLDNIDVLNSFGGEDGKNGSVNVEEMESSRGSGTKKTNGGSCCSDSEEESSASGNIKAAVSSSSGVKRRAGADIARSSRHYRSVSMDSCLMGKLNFGDELLPASSTKVSPTNSGEGNSSAAFSVEFGNGEFTAAEMKKIEADEKLSEITTADPKRVKRILANRVSAARSKERKTRYMAELEHKVQTLQTEATTLSAQLTHLQRDSMGLMNQNSELKFRLQAMEQQAQLRDALSEQLTAEVQRLKLMIGNPSHMQSDSNSESKMSKTSLNQEMFQQLSISQLQPQQMQQSKQNKTMKPKNASNE
· CDS sequence: (9687 bp)
>Lmscaffold962.30
ATGTTGTGGTGTGGGCGCCTGAGTCCAATAACAATAGTCCAAAGTCCCGTGCGCCGGACAAGACTCTTAAGCAGAGCCCAAGGCCTTGGAGGAGCCACCGAGAATCAGAAGACGAACAGGGTTGTTGTTGTGGGTTCTGGCTGGGCTGGTCTTGGTGCTGCTCACCATCTTTGTAACCAGGGCTTTGATGTCACAATTCTCGACGATGGCCCTAGTCCTCATGATATTGGGATCCAAGGGTTCTGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTCCGGAGATGAATTACAGGCTGAGTTTCCTGTGTTTCAAGAGCTTCCTCAGCTGCCAACTCCTTTAGGAACTCTCTACTATTCTCAGTTTTCTTGGCTTTCATTAGCGGACAAGATACCTTCACTTCCTCTAATGGCTGCAGTTATCGATTTTGATAACACAGATGCAGCTTGGAGGAAGTACGACTCAGTGACTGCAAGGGAGTTGTTTAAGCAGTTTGGATGCTCAGATAGTCTATACCGGGACATCTTAAGGCCATTGCTTCAGGTGGGTCTGTTTGTTCCACCTGAGCAGTGCAGTGCGGCTGCTACACTTGCTCTCTTTTGTTACCTCATTGTCTCTCATCAAAAAGACTTTGACATGGTGTGGTGCCGAGGTACGGTGAGGGATATGATCTTCAAACCCTGGACTGACTCTTTGAAGGAAAGAGGTTGCAGATTCCTTAAAGATAAGCTCGTGACCGACTTCATCCTTAACGATGACGATTCTGGTAATGTTACGCAAGTTGTCTGCGGACGAGATAATTTTGAAGTGATCATGGAAACTGATACTTGGGCTTTATCCATTTTTAGTGCAGCGTTGTGTAAGCGAGAGGAGTTTCTGAGAGTCTTGAATCTAACATCTGTAGATGTCGTCTCTGTTGCTATTCCACATGCTTCAAATGTATGTTCTTCAGATTCATACGGATGGACATTCTTTGACCTAAACTCTATTTATGACGAGTACAAGGAAGACGAAGAAACTGTGGTTCGAGCTGATTTTTATAACGGGAGTGAGCTAATGGGAACGACAGATGAAGTAATAGTGGAGAAAGCAATGTCTTACATATCAAAACACGTGAAAGACTTGAAGAAAGCAGTTGTAAAAGAGGCAGATGTAGAGAGATTCCCTGAATCACTCCCACGTTTCTTCCCAGGGTCATACAAGCACATGATGAGAGGCTCAACATCAAAGCTGCAAATGGAGTGGTTGATCTCTTGGGAGAAGGAAGCTTTGCAAGAATCATACCACTCGAAGAAGAAGAGCCTCATATTGAAGCTCTTAGATATCTCAATCGAAACTTTGCTCAGCTCTTGTCTCAGCTTCCCTTCTCAGCCTACTGATAACAATATTCTACAAATCATACCAAGATCGACATCATCACAAAGGTTTCCGACGAACGGCGCTTGTTCTCAATTCACCGGAGTTTGCATGACAGGAAAGGGGCATGGGGAGAGTGGAGAGGTCGTAGCTTCTGCGATAGTGAATATGGCGAACGACCATAATCTCTCCAGCTTGGTTCACGAACTCCGGGAACGCGTCGCCGCATCTACTTCGAGTCCCGTAAACAACCTCCATCACTCTTCTGGAGACGACGATGCTCTTGAGATTCGATTTCGGACTGTCATCCCTAATCTTTTGAATACCTACGTTGTCCTTTCTCTTGACAACAGGAGGGAAGTTACAGCTGTTCTGAAGCTTGTTGGTCATACAGCTAGGACCATTCCAGGAGTTTTCTTTCACGGAAATCCTTCTGCTATTTTCCCTGTGATTGCTCGTATTATGCCCTTCTTTGCAGAACCAGATTTTGTTCCTGCGCATGGTGTAATTCTTGAAACTGTTGGATCCCTCTTAATGTTGCTCCGTTCCAACTCAAGGAAGGCGTATCGGATGTTCTTCCATGACGCTTTGCAGGCCATTGAAGATATGCAACTTATTGCATCAAATGTACCTGAACTTTGTGAATCGGACACACCGTTTAGGTGTTTCTGTATGTCATTTTCTAGAATTTGGGGCGATTCTTGTCATTTTTGTGATCTGCCAGATACTAATAAGCCCAAAGATGGAGATGGTATTGTGTTGGACTTATTGGGAGGCAAACGATGGCAACCTTTTGCTACTTGTATCCTTAAACTCATCTGCAAATGCGTAACTGAGGGGACACTCTATGCCGAGGGTCTCATCCATACATCATTTGTTAAGGCTGCTTTTTCTTTAGTATGCTGTGATAGCGCAGATGTGCAGATGGCATGCTTTGAATTTGCTTCTCTTGTCGGATCAATCCTTAGTTTCAACATCCTTCCTCATTTGGGCTTGATAAAGTCAATCATCCTCCTTCTAAGTGCAGATCAAGAAGGACTCCCTCTGTACAGGAATGCGATTTATGATTCTACCATTGGACGTTGCCTTATGGCAATATATGCCAGCTGTTCGGATGTCGTTGTCAAACTAACTGCAGAAAGTTTAGTGTTGGTCTTCCCTCATGCTTTACAGAGAACAAGGAGTGAGGAACTTAAGGCTTCCCTGGGCAGTGCTTATGTGCGGATTGTAAAATCTTGTCCTCCTTGTATCTGGAATCTAAATTGCCTTCTACAGTTGCTTCATCTTTCAGAACCTTGTTTTCAATTGATAGAATGTTTCAAAGCAGTTCTTGTAGTTCTTGAATCTGGTTGTGTTCGAGGTGAGACAACCAAATATGGTAGTCATGCGTCATACAACCTTGGACCCATCCAGGGAACTAAGGTTGGACAAAAAAGACATATTAAGGATGGAAGTAGCTATAAAAGGAAGCGCCAGAAGGTTGGTGATGAGGTTCAACAAGAGGTTTACTGTGCTCCTGAATTTGGCGATGAAATTGATGGAAAAGAAGCTGCCAGCCTGCGGGAGATGCTAATTTCAACTGTAGAATCTTTAAAGCCACCACCTGCTAGACCTAGTCTGTTGCAGACTGAAATTTCTCTAGTGGCACTTACCATGCTTACCAATGCGTTTTGCTTCTCTCCCTGGACTGACATGACTCATCTCTTGTTACACCAGATGTATTCCTGGATTCCCTGGATAGTTGAGCAGGTTGAAAACGAAAGTCTTACCATGTTTGATATTTCTCTTTACTTGGAAGGAATTCACAATTTGCTGCTTGTGCCTGACTTGGATTCACAATATGAATATACACGTAAAGGGAATGACTTGGAGGCATTACAATTCTTGCTGAAGCTTCCTTGGACGCACTTCATGCTGTTTAAGAAGCCTAGCTCTCTATTAAAGTCAAAGTGCTTATCTGTGGGGATATGGACAAAGCTTGGTTCACGAGACGGGAGAGATTTTGAAATCTTCAATCTGGCACTTTCTGATGATTTGGAACACGTGCGAGCGGTCGCTGTTATCTCCATGCCACTCAAAGTTCTTTTCTCTGATCTTGATTCTCTTCCTCATATATTCCGAAGGCTGGAGCCTTTGTTAAAAGAGGAGCATTTGATGGTTAAGAAGAGCATTCCTCAGTCTCTTGGCTTCTTATCGTGTCTTTATGGATCAAGTACTACTGGCTCAGAAAAAGCTGCATGCTATTTATATTTACATGAAGATACAAAGAAAGATGGGAGTCTGAATTGTCTACTTCAAGGGTTCCAATGTTCAAAGTGTGATAAATTTATAAAAAGGAAAACTGAGAAGCATTTCAAAGTGTTAGAGACTCCGGAGATGGTGAAAATGAAAATGGATCATCAGCATGATTACCTTAACCTTCAATCCTTATATTTTAATCTTCTCTATGATGAGTCTTCTGAAGAGACTCAGCTAGCCTGCGTACAAGTGATTGGGAGAGTTCTTGGCCATATGACCTCAGATATTCTGGTCAGAACAAGGTCGCAATGGATAAGATGCCTTCGATACCTTTTACTTCATGTAAATTCAGATGTAAGGGAAGCATTATGTGGTCAGATAGGTATCTTCGTACAGCATCCTATTTTGAGTTGTTTGTTTCTTGGTGAAGAAGCTATTGAGAAAAGTTGTGAAAGAAATTTTTTTAATTTGATTGAGCATTCTTTAGCAACAGCCAAGGGTCTTCATTTCATCCAGACTCTCTTGGAAACGACAGCTGAAGTTATGGTAATTGTTGATGTTACCAGTGAGCTCTTCTTGTTCTGTCTTTTCCAGCTGATTGATCAGCTTGATCATTCGAATCTGATCGTTCGAATAAATGCGTCAAGGTTGATAAATCGGGCGTGCTACGTCCATGTGAAAGGGGGATTTGCGACACTACTATCCAAAGCTGTTCATATCCAAGATGACTTGTTTAATAATCTATCTATTAGGCTGACCAGTCGTCCAGATGTGATTAGAGAATTTGCAGAGGCTGTTATGGGTGTTGAAACCGAAGAACTTGTGAGAAAAATGGTCCCTGTTGTTCTTCCCAAGCTCTTGGTATATTGGCAGGAAAATGCTCAAGCTGCCGATATCTTGAACGAACTGGCTAAGTTATTAGACACAGATGTGGTACCTCTAATAATCAATTGGCTGCCCAGAGTTCTTGCATTTGCTCTGAATCAAGAAGAAGACAAAAATCTGCTCTCAGTTTTGCAGTTGTATCATTCACAGACTGGTTCTGACAACCAAGAAATTTTTGCTGCAGCATTACCTGCACTCTTAGATGAGCTTGTATGCTTTGTGGACGTTGCTGATAAACCTGAGACAGAGAGACGGCTACAGAGACTACCTGAGGCAATAAAGAAGATCTCAAAAGTTTTGACAAATGCTGAAGATCTTCCTGGATTCTTACAGAATCATTTTGTTGGACTCCTAAACAGTATTGACAGAAAAATGCTACATGCAGATGATATTCTTATTCAAAAACAAGCGTTGAAGCGTATTAAGCTGCTTATTGAGATGATGGGCCTCTATCTTAGCACATACGTCCCGAAGCTAATGGTTCTCCTAATGCATGCAATCGACAAAGATGCACTTCAGAGCGAGGGCCTCTTGGTCTTGCATTTTTTTACAATAAAGTTGGCTGCCGTATCACCATCCAGCATAAAGCATGTAATTTCTCAGGTTTTTGCTGCACTCATCCCCTTCTTAGAGAGAGAGAAAGAAGGTCCCCACGTATATTTGAATGAAGTGGTGAAAATTCTTGAAGAACTTGTTTTGAAGAATAGAGATATACTAAAGCAGCACATCTGCGAGTTTCCCCTCTTACCTAGTATACCTTCTTTAGCAGAATTGAATAATGCTATTCAAGAAGCACGTGGATCAATGAGTCTAAAAGATCAGTTGCGGGATATTGTAAATGGTATGAAACATGAGAACCTAAATGTTAGGTACATGGTGGCATGTGAGCTAAGCAAATTGCTGACTCATAGAAATGAAGATGTTACTGCACTGATTGCTGGTGAACTTGTCTCAGACATGGAGATCGTGAGCTCTCTGATCACATCTTTACTACAGGGATGTGCAGAAGAATCACGAACTACAGTGGGTCAGAGGTTGAAGTTAGTCTGCGCAGATTGTCTTGGAGCAATAGGTGCTATTGACCCTGCCAAAGTGAGAGTTGCTTCATGTAGTCGTTTTAAAATCCAATGCTCAGATGATGATCTTATATTTGAGCTCATTCACAAACACTTGGCAAGAGCTTTTAGAGCTGCACAGGATACAATCATACAAGACTCAGCTGCTCTTGCCATACAGGAGTTACTAAAGATTGCTGGTTGTGAGCCATCTTTAGCTGGGAGTGTTGTTGTTTTTACACCACAGGAGCATGGAAAACTTAATGTATGTGGTTCTAGAATATCTGGAGCTAATAATGAAGTGATTGATAGGGGGAAAAAACTATGGGACCGGTTCTCAAGCTATGTCAAAGAACTAATAGCTCCCTGCTTGACATCAAGGTTTCAGCTCCCAAATGTCTCTGACCCTGGAACAGTTGGACCAATATATCGGCCTTCTATGTCATTCAGAAGGTGGCTATCCTACTGGATAAAGAAATTGACAGCACATGCAACTGGATCCCGTGTAAACATATTTGCTGCTTGCCGAGGCATAGTGCGTCACGATATGCAGACGGCGACTTATCTCTTACCATATTTAGTTTTGGATGTTGTTTGCCATGGGACTGAGGCAGCACGGCTTAGCATATCAGAAGAGATCCTTTCTGTTCTTGATGCTGCTGCATCAGAAAATAGTGGAGAGACGATAAGCAGCTTTGGTGTTGGTCAGAGTGAAGTTTGTGTTCAAGCTGTTTTCACGCTTCTTGATAACCTTGGGCAATGGGTTGATGATGTGAAGCAGGGAGTAGCACTCTCATCGTCTATGCAGTCAGCAGGCGGTAGGCAAGTAGCACCAAAATCGAAAGACCAGGTTTCAACCTCAACAACAGAACAGGATCAACTTCTACAATGTAAATATGTGTGGGAACTTTTGCTTGCTATTCCCAAGGTTACCCTTGCTAGGGCATCTTTCAGGTGTCAAGCTTATGCCAGGTCATTGATGTACCTGGAATCTCATGTACGTGGAAAGTCAGGCTCCTTAAATCCCGCTGCTGAGAAGACAGGGATCTTTGAAAATTCTGATGTTTCTTCTCTGATGGGAATATACAGCTGCCTTGATGAGCCTGATGGTCTTTCGGGCTTTGCAAGTTTAAGCAAATCATTAAGTTTGCAAGACCAGTTGTTGATAAATAAGAAGTCTGGTAATTGGGCAGAAGTGTTTACTGCATGTGAACAAGCCCTTCAGATGGAACCAACATCAGTTCAAAGACACTCTGATGTACTTAATTGCTTGCTTAACATGTGCCACCATCAGACAATGGTCACTCATGTTGACGGACTAATTTCCAGAGTACCTGAGTACAAGAAAACGTGGTGCACACAAGGTGTACAAGCTGCATGGAGACTTGGAAAGTGGGACTTGATGGATGAGTATCTTGGTGGAGCTGATGCAGAAGATATACTATTCAGTAGCTCAGACAGTAATGCCTCGTTTGACAGAGATGTTGCAAAGATTCTCCAAGCAATGATAAAGAAGGATCAATATTCTATAGCTGAAAGAATAGCAATGTCCAAACAAGCTCTCATTGCTCCTCTAGCTGCTGCAGGCATGGATTCTTATACTCGAGCATATCCTTTTGTTGTCAAACTTCATCTGCTAAGGGAGCTAGAGGACTTCCAGGGTCTTCTTAATGGGGATTCATATTTGGACAAATCATTTAGTACAAGCGATCCAGTGTTTTCAAAAGTAGTACATAACTGGGAGAACCGTCTAAGATTTACTCAGTCATCATTGTGGACAAGGGAACCTCTCTTAGCTTTTCGAAGACTCGTCTTTGGTGCCTCTGGGCTTGGTTCTCAAGTCGGCAACTTCTGGCTTCAATATGCAAAGCTTTGCCGTTTGGCTGGACATTATGAGACAGCTCACAGGGCGATTCTGGAAGCTCAGGCTTCTGGTGCACCTAATGTTCACATGGAAAAGGCTAAATTGCTTTGGATCACAAGACGTTCGGACAGTGCCATTATAGAGTTACAACAGTCTCTCCTGAATATGCCTGAGGGAGTTGTTGACTCTGCTGTAATTTCTTCTATCAATAGCTTACTGATGGCTCCTCCGAATGCAGAGCCGAGAGTCCGTGACACTCAATCTTTCAGTGAAAAAAAAGATATTGCGAAAACTCTTCTTTTGTATTCCAAATGGATCCAAGACACTGGGCAAAAACAAAAGAAAGATGTTTTAAATCTTTACACCCAAGTAAAGGAGTTGCTGCCCTGGGAGAAGGGATATTTTCATTTGGCTAAGTATTGTGATGAACTATATGTTGATGCTAGAAAGTGTCAACAAGAGAGTTTTGTATTGAACTCTGGAGGCAGCAAAAAAGGTTCTGTCTCGTCAAACTCAAGTACTGAGAAAGCAGGGTTGGATTACCTATTTAAGGCAATGTACTTCTATGCGAAGGCACTTCACAGTGGGCACAAGAATCTCTTTCAAGCACTTCCGAGGTTGTTAACCCTATGGTTTGACTTTGGTACTATGTATCAAACAAGTGGTTCAGCGGGAAATAAGGAATTGAAAAGTACTCATATGAAGATTATGAGTTTAATGAGGGGCTGCTTAAAGGATCTGCCAACCTATCAATGGTTAACTGTGCTGCCTCAGTTAGTTTCTAGAATCTGTCACCAGAATGGGGATACAGTACTAATGGTTAAAAAAATCATCACTTCTGTTCTACATCAATTTCCTCAGCAAGGGCTCTGGATTATGGCAGCTGTTTCAAAATCTACTGTTCCTGCTAGGAGGGAAGCAGCTGCAGAAATCATTCAAGGTGCACGAAAAGGTTTTAACCAAAGTGAGAGAGGCCACAATTTGATCATTCAGTTTGCTAGTTTGACTGATCATTTAATTAAACTGTGCTTCCATGGAGGACAACCAAGATCCAAGGTTATCAATATAGCAACTGAATTTAGTGCCTTGAAAAGAATGATGCCGCTGGATATCATCATGCCAATTCAACAATCTCTTACCATTAGTCTACCAGCATTCGAAATGAACAACAATGAACACTCTACCAGTGTCTTTTCTGGTTCAGATCTACCAACAATTTCTGGTATAGCTGATGAAGCCGAGATACTTTCATCCCTTCAGCGCCCCAAAAAGATCATTCTGCTGGGAAATGATGGTATCGAGTATCCATTCCTCTGCAAGCCTAAGGATGATCTCAGGAAAGATGCTCGGATGATGGAATTTACTGCAATGATAAATCGTTTACTATCTAAATATCCTGAAAGCAGGCGAAGGAAGCTATATATCCGCACTTTTGCAGTAGCGCCTCTGACTGAGGACTGTGGACTGGTGGAGTGGGTTCCACATACACGTGGACTCCGCCATATTTTACAAGATATATACATAGCATGTGGGAGGTTTGATCGGCAAAAAACAAATCCTCAAATTAAAAGAATTTATGATCAATGTGCTGTTAGAAAGGAGCATGAGATGCTGAAGACCAAGATCCTTCCTATGTTCCCTCCAGTCTTCCATAAATGGTTCTTGATGACATTTTCTGAACCAGCTGCATGGTTTAGGTCACGTGTAGCTTATGCTCACACCACAGCAGTCTGGTCCATGGTAGGGCACATTGTTGGACTTGGTGACCGTCATGGAGAAAATATACTTTTTGATTCTACGTCAGGTGATTGTGTTCATGTAGACTTCAGTTGCTTATTTGACAAAGGTCTACAACTGGAGAAGCCTGAGTTGGTGCCCTTCAGATTGACCCAGAACATGATCGATGGTTTGGGCATCACTGGATATGAGGGCATCTTCATGAGGGTATGTGAAATTACTCTCACAGTGTTGAGAACACATAGGGAGACACTGATGAGCATCTTGGAGACCTTCATCCATGATCCACTTGTGGAGTGGACGAAATCACACAAATCAAGCGGAGTAGAAGTTCAGAACCCACATGCTCAGCGAGCCATAAGCAGCATTGAAGCTCGACTGGAGGGTGTCGTTGTTGGTGTTCCGCTACCAGTAGAAGGTCAAGCTCGTCGGTTGATTGCTGACGCAGTCTCACTGGAGAATCTTGGGAGGATGTACATTTGGTGGATGCCTTGGTTCTGA
· Genomic location:
scaffold962:232676:234792:-